Даниил Алексеевич Путилов родился, вероятно, около 1701 г. на территории Шелонской пятины Новгородского уезда, в 1714 г. определён в математическую школу, в 1715 г. Петром I зачислен в Морскую Академию, готовившую специалистов в области навигации, артиллерии, фортификации и устройства корабля. В 1716 г. Д. Путилов получил чин гардемарина.
«В январе 1716 года, осматривал нас Государь в доме графа Ф. М. Апраксина, и я был записан в числе 40 человек во флот, послан с ними в Ревель (ныне Таллин). Здесь определён я на корабль „Архангел Михаил“ к капитану <Томасу> Рю гардемарином, и с того времени восприяли гардемарины начало», – писал С. И. Мордвинов.
После непродолжительного плавания в Балтийском море и учёбы на корабле в том же 1716 г., когда российский флот стоял в Копенгагене, Пётр I, находясь на корабле «Ингерманланд» распределил гардемаринов на дальнейшую учёбу, 20 младших в том числе Д. Путилов и С. Мордвинов были посланы во Францию. В феврале 1717 г. гардемарины прибыли во французский порт Брест и обучались частью в Бресте, а частью в Тулоне. Гардемарины во Франции слушали курсы в морских училищах, затем служили на французских военных кораблях.
Служба С. И. Мордвинова во Франции продолжалась до июля 1722 г., когда он был пожалован Людовиком XV в корабельные поручики и отправлен в Россию. В мае 1723 г. С. И. Мордвинов произведён в мичманы российского флота.
Какова в этот период судьба Д. Путилова, мне достоверно неизвестно, но, вероятно, она была похожа на судьбу С. Мордвинова, так-как в том же 1722 г. гардемарин Данила Путилов прибыл из Франции и держал экзамен. В 1723 г. был повышен в чине до мичмана.
10 января 1724 г. и Д. Путилов и С. Мордвинов произведены в унтер-лейтенанты. С 19 марта 1731 г. Путилов – лейтенант. 18 января 1733 г. Путилов по новому штату записан в лейтенанты майорского ранга и отправлен в Архангельск.
В 1733 г. главный командир Кронштадтского порта капитан-командор И. А. Брандт рекомендовал одним из кандидатов во Вторую Камчатскую экспедицию под руководство Витуса Беринга в том числе и лейтенанта Путилова, но данного назначения не произошло.
В 1734 г. Путилов вернулся в Петербург из Архангельска.
3 января 1736 г. Даниле Путилову поручено отвезти в Санкт-Петербург 3000 рублей из Новгородской губернской канцелярии. Из чего следует, что он в 1735—36 гг. побывал на своей малой родине, возможно в отпуске, возможно по служебным делам.
В том же 1736 г. лейтенант Д. Путилов – капитан пакетбота «Курьер» на котором ходил между Кронштадтом и Любеком.
В период 1738—1739 гг. лейтенант Д. Путилов являлся главным командиром Ревельского порта.
3 ноября 1740 г. Даниил Путилов получил звание капитана полковничьего ранга.
В феврале 1741 г. капитан фрегата «Вахмейстер» Даниил Путилов назначается командиром эскадры для доставки грузов из Ревеля в Архангельск. Перевозимым грузом было парусное сукно, комплект артиллерийских орудий, якорей и прочего оборудования для новых строившихся судов. В эскадру Д. А. Путилова входило три фрегата, кроме «Вахмейстера» – фрегаты «Кронделинде» под командованием капитана С. И. Мордвинова и «Кавалер» под командованием капитана А. И. Нагаева. Эскадра снялась с якоря в Ревеле 11 мая 1741 г., 19 мая эскадра прибыла в Копенгаген. Обогнув Скандинавский и Кольский полуостров, к 7 июля корабли вошли в Белое море и бросили якорь у острова Мудьюг, в тот же день эскадра прибыла в Архангельск.